明弘治十一年（1498年），浙江右参政周木将宋报恩寺旧址改建为书院，书院名取自唐朝白居易《夜归》中“万株松树青山上，十里沙堤明月中”的意境，曰“万松书院”。书院奉先圣孔子像，时请孔子第五十八代孙生员孔衢、孔绩来院掌供祠事，并世代相守。其后因战乱等种种原因屡圮屡建。康熙十年（1671年），浙江巡抚范承谟重建万松书院，改称太和书院。康熙五十五年（1716年），康熙御书“浙水敷文”（“敷文”取“君子博学于文”之义）匾额，书院遂易名为敷文书院。乾隆也曾四度亲临，赐额“湖山萃秀”。
万松书院 韩盛 摄
万松书院是杭州明清时期规模最大、历时最久、影响最大的书院，与当时的崇文书院、紫阳书院、诂经精舍并称为杭城“四大书院”。书院又因梁山伯、祝英台同窗共读的民间传说而闻名。后因书院于清光绪年间迁至葵巷，原址逐渐荒废。
《南巡盛典名胜图录》中的敷文书院图
2002年，万松书院依照明代格局重建后对外开放。2004年，杭州又增建万松书院国学馆“正谊堂”及部分配套设施，恢复了古代书院讲学、祭奠、藏书三大功能。2007年，“万松书缘”入选三评“西湖十景”。
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